閉鎖性水域であり，優れた自然景観地である瀬戸内海の環境保全を推進するため、昭和48年に瀬戸内海環境保全臨時措置法が水質汚濁防止法の特別法として制定され、その後昭和53年に現在の瀬戸内海環境保全特別措置法となりました。 特定施設の設置の規制等 みなし指定知育特定施設の届出義務化 ＣＯＤの総量規制及び富栄養化対策 自然海浜の保全
特定施設の設置の規制等 水質汚濁防止法においては，特定施設の設置は届出制ですが，瀬戸内海環境保全特別措置法の対象地域（倉敷市は市内全域）において，１日あたり最大50ｍ3 を超える水を排出する場合には許可制となり，行政の許可を受けなければ特定施設の設置や変更を行うことができません。また，設置等に伴い，汚濁負荷量が増加するなどの場合，周辺公共用水域の水質の事前評価を行う必要があります。
ＣＯＤの総量規制及び富栄養化対策 化学的酸素要求量（ＣＯＤ）の汚濁負荷量の総量削減規制について，本法において定められています。また，富栄養化対策として窒素・リンを指定物質に定めてその削減指導を実施しています。なお，平成14年からは，水質汚濁防止法に基づく窒素・リンの総量規制も実施されています。